迄今最大海洋微生物基因數(shù)據(jù)庫(kù)出爐
圖片來源:《自然》網(wǎng)站
科技日?qǐng)?bào)記者?劉霞
據(jù)英國(guó)《自然》雜志網(wǎng)站16日?qǐng)?bào)道,沙特阿拉伯科學(xué)家對(duì)包括細(xì)菌、病毒和真菌在內(nèi)的海洋微生物基因進(jìn)行了迄今最全面分析,編制出已知最大海洋微生物基因數(shù)據(jù)庫(kù)。其中囊括了來自北極、印度洋、大西洋、太平洋以及地中海的約3.17億組微生物基因。最新研究為科學(xué)家發(fā)現(xiàn)抗生素、追蹤氣候變化影響和保護(hù)瀕危物種奠定了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。
最新研究負(fù)責(zé)人、阿卜杜拉國(guó)王科技大學(xué)海洋生態(tài)學(xué)家卡洛斯·杜阿爾特認(rèn)為,他們繪制的全球海洋基因目錄1.0,是對(duì)海洋完整多樣性的理解的一次飛躍。新目錄包括了來自深海和海底微生物的基因組數(shù)據(jù),而此前的目錄主要基于棲息在距離海面200米左右的微生物。
在最新研究中,研究人員使用超級(jí)計(jì)算機(jī)分析了海洋微生物的基因數(shù)據(jù),使用算法預(yù)測(cè)了數(shù)十億個(gè)基因的完整序列。他們將這些填充序列與功能已知的微生物基因進(jìn)行了比較,從而確定了不完整基因的作用。
研究發(fā)現(xiàn),“黃昏帶”區(qū)域一半以上的基因組來自真菌,該區(qū)域位于海面下200米至1000米之間。這表明真菌在處理海洋中的有機(jī)物方面發(fā)揮的作用比以前認(rèn)為的更大。分析還顯示,一些海洋病毒含有更多的新基因序列。
研究人員強(qiáng)調(diào),來自海洋微生物的基因和蛋白質(zhì)用途很多,深入了解有望發(fā)現(xiàn)新抗生素,找到用于食品生產(chǎn)的新酶。該數(shù)據(jù)庫(kù)還可作為海洋微生物多樣性的測(cè)量基準(zhǔn),使科學(xué)家能夠跟蹤燃燒化石燃料或深海采礦等活動(dòng)的影響。
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