最近,英國出現(xiàn)新型新冠病毒突變毒株,其傳播力更強(qiáng),一時間人們談虎色變。法國關(guān)閉了英國入境口岸,近3000輛卡車因不能入境在排隊(duì)等候。除了法國,全球有50多個國家禁止英國游客入境。新冠病毒突變帶來的另一個問題是,即將上市的新冠疫苗還能抗擊新毒株嗎?昨天,BioNTech CEO信誓旦旦稱,相信他們研發(fā)的疫苗對新的病毒毒株同樣有效。
英國曼徹斯特的一幅壁畫描繪的一位護(hù)士 Unsplash/Matthew Waring
撰文丨戴 威 唐金藝
責(zé)編丨陳曉雪
因新出現(xiàn)的新冠病毒(SARS-CoV-2)變異,英國政府于12月19日宣布對包括倫敦在內(nèi)的英格蘭東南部施行4級封鎖,這意味著這些區(qū)域的人們須待在家里,即使圣誕節(jié)也不能與其他家庭的人聚會。
這一新的變異主要是新冠病毒S蛋白受體結(jié)合區(qū)域(RBD)中的關(guān)鍵氨基酸突變N501Y。已有研究表明,這使得新冠病毒更容易與人的受體ACE2結(jié)合,從而使其具備加快新冠病毒傳播的潛力。
倫敦大學(xué)國王學(xué)院病毒學(xué)家斯圖亞特·尼爾( Stuart Neil)表示,幾周前這種變異病毒只與10%~15%的病例有關(guān),而在上周已占到倫敦病例的60%。
英國在12月2日結(jié)束了為期四周的第二次封城,但新增感染人數(shù)在11月末的短暫回落后快速攀升。12月20日,英國單日新冠確診人數(shù)達(dá)到35928人,已超過第二次封城前的峰值,并達(dá)到疫情以來最高點(diǎn)。圖為英國政府統(tǒng)計(jì)的單日新冠新增確診人數(shù)(左)與死亡人數(shù)(右)。圖源:https://coronavirus.data.gov.uk/
12月13日,英國近60個地方部門確認(rèn)有1108例病例感染的是產(chǎn)生了這種變異的新冠病毒,而實(shí)際感染人數(shù)可能高得多。
那么,這一新的變異意味著什么?對目前的疫情防控有何影響?會影響到即將上市的新冠疫苗的效果嗎?
英國新冠病毒出現(xiàn)變體
作為RNA病毒,新冠病毒出現(xiàn)新變體并不奇怪。
“病毒基因突變是永恒的,我們所能檢測到的變異都是能成功存活和傳播的病毒。”研究冠狀病毒多年的中科院武漢病毒研究所研究員石正麗表示。
從第一條新冠病毒基因組序列上傳至數(shù)據(jù)庫開始,科學(xué)家們一直都在實(shí)時監(jiān)測新冠病毒的演化情況。
一般來說,一個新變體受到關(guān)注,要么是循環(huán)的頻率突然變高,如歐洲的D614G變體,后續(xù)的實(shí)驗(yàn)證據(jù)也表明感染性確實(shí)增強(qiáng);要么就是臨床特征明顯改變,如早期新加坡的ORF8缺失變體,后續(xù)的實(shí)驗(yàn)表明該變體的致病性變?nèi)酢?/p>
這些臨床變化肉眼可見,但其誘導(dǎo)的免疫學(xué)特征是否改變需要更多的實(shí)驗(yàn)來證明。從目前大多數(shù)新冠病毒毒株的突變程度來看,誘導(dǎo)的免疫反應(yīng)并未發(fā)生明顯改變。
本次英國的新冠病毒新變體,就是通過監(jiān)測數(shù)據(jù)庫發(fā)現(xiàn)的。根據(jù)其突變特征,在系統(tǒng)發(fā)育樹中被劃分為一個新的支系 B.1.1.7。在過去的四周,該譜系頻率迅速升高并在英國地區(qū)持續(xù)擴(kuò)散。
最早的兩株,一株來自2020年9月20日的肯特,另一株來自2020年9月21日的大倫敦區(qū)。到2020年12月初,英國持續(xù)檢測到B.1.1.7譜系感染,截至12月15日,B.1.1.7譜系共上傳了1623個基因組序列,其中519個在大倫敦區(qū),555個在肯特,545個在英國其他地區(qū)(包括蘇格蘭和威爾士),還有4個在其他國家。
“沒有數(shù)據(jù)顯示這是由國外帶進(jìn)來的”,伯明翰大學(xué)微生物基因組學(xué)和生物信息教授尼克·羅曼(Nick Loman)認(rèn)為,“它可能是在英國內(nèi)部演變出來的。”
B.1.1.7譜系的系統(tǒng)發(fā)育樹及突變位點(diǎn)
對于新冠病毒來說,突變隨著時間的推移,以基本恒定的速度積累(約為每月1-2次突變),目前大部分毒株與原始毒株相比的突變一般為數(shù)個,但B.1.1.7譜系積累的突變位點(diǎn)很多,主要有6個同義突變、14個非同義突變和3個缺失突變,演化速度異常,與根部的距離較遠(yuǎn)。
目前還不知該譜系的來源,有推測可能是由于免疫缺陷患者的慢性感染或藥物,如康復(fù)患者血漿或瑞德西韋等選擇壓力產(chǎn)生的,此前也有證據(jù)顯示選擇壓力會導(dǎo)致新冠病毒演化速度加快。
世界衛(wèi)生組織新冠應(yīng)對工作技術(shù)方面負(fù)責(zé)人瑪麗亞·范·克爾科夫(Maria Van Kerkhove)則表示,這一病毒變異已經(jīng)受到世界衛(wèi)生組織的病毒進(jìn)化工作組的監(jiān)控。“這一變異情況同在別處發(fā)現(xiàn)的貂變異體有所聯(lián)系。”
B.1.1.7譜系(藍(lán)色)及系統(tǒng)發(fā)育樹中的外群譜系(棕色)序列遺傳距離對采樣日期的回歸分析
新變異毒株意味著什么?
具體來說,英國新變異的毒株,發(fā)生了哪些變化?
在B.1.1.7譜系S蛋白的突變中,最值得注意的突變位點(diǎn)是RBD(受體結(jié)合區(qū)域)中的關(guān)鍵氨基酸突變N501Y,這個位點(diǎn)尤其重要。今年7月30日,中國科學(xué)家周育森等人發(fā)表在 Science 的研究表明,新冠病毒適應(yīng)和感染野生型小鼠,正是因?yàn)橛辛诉@個 N501Y突變。該突變大大增加了RBD與受體ACE2的親和力,能使本來不感染小鼠的新冠病毒毒株變得能夠感染小鼠。
而今年9月發(fā)表在 Cell 的一篇論文顯示,美國福瑞德·哈金森癌癥研究中心和華盛頓大學(xué)的科學(xué)家發(fā)現(xiàn),新冠病毒受體結(jié)合區(qū)域相當(dāng)多的氨基酸突變增強(qiáng)了與ACE2結(jié)合的能力,其中就預(yù)測了位點(diǎn)N501F/T的突變增強(qiáng)與人ACE2親和力,但他們當(dāng)時并沒有證據(jù)表明正在流行的毒株產(chǎn)生了這些突變。
另一個值得關(guān)注的突變位點(diǎn)是N端結(jié)構(gòu)域(NTD)中的H69和V70缺失突變(69-70del),這一變體最早在7月份出現(xiàn),英國、荷蘭、澳大利亞也均出現(xiàn)過,后來在丹麥的水貂中頻繁出現(xiàn)而引起廣泛關(guān)注,其中在水貂中常伴隨Y453F共同出現(xiàn),而在人類中則常伴隨N439K共同出現(xiàn)。有研究表明,69-70del突變會逃逸一些單克隆抗體的中和作用,也可能會降低部分血清的中和敏感性。
S蛋白中的P681H突變可能也對病毒特征有潛在影響,這一位點(diǎn)緊鄰S蛋白的S1/S2 Furin裂解位點(diǎn),F(xiàn)urin裂解位點(diǎn)對新冠病毒感染宿主細(xì)胞至關(guān)重要,所以推測P681H對新冠病毒的感染性也可能有所影響,但目前還沒有明確的實(shí)驗(yàn)證據(jù)。此外,S蛋白中的其他突變位點(diǎn)推測對功能影響不大,尚未引起關(guān)注。
除了S蛋白外,ORF8中的Q27stop突變使ORF8蛋白提前編碼結(jié)束,失去功能。在大流行早期,全球范圍內(nèi)分離出多個ORF8缺失突變毒株,也有多項(xiàng)研究對其闡述過,該毒株在人類原代氣道細(xì)胞中輕微影響復(fù)制,并且與較輕的臨床感染和較少的感染后炎癥有關(guān),即致病性有所減弱。
截至目前,其他的突變位點(diǎn)尚未得到明確的描述。重要的是,考慮到這一新變體包含多個突變位點(diǎn),所以其具體功能應(yīng)考慮所有突變位點(diǎn)的綜合結(jié)果,目前還未有確切的證據(jù)證明這一新變體對病毒學(xué)和免疫學(xué)特性有何影響。
有評論認(rèn)為,以英國的形勢來看,很有可能像D614G變體一樣大大增強(qiáng)傳染性,是否影響致病性和免疫逃逸等因素還需后續(xù)更多的實(shí)驗(yàn)證據(jù)。
根據(jù)英國新發(fā)呼吸道病毒危機(jī)咨詢小組在12月18日的會議紀(jì)要,新毒株感染病例的增長率比其他毒株高71%。
英國衛(wèi)生大臣馬修·漢考克(Matt Hancock)強(qiáng)調(diào),目前沒有任何跡象表明,新的病毒變體會導(dǎo)致更嚴(yán)重的疾病,或者疫苗不再起作用。
值得注意的是,目前領(lǐng)先的疫苗大多采用S蛋白作為免疫原,包含多個抗原表位,誘導(dǎo)多克隆抗體血清,即使有些突變位點(diǎn)能夠逃逸單克隆抗體,也不會對整個血清的中和性有很大影響。例如,上述 Science 的論文顯示,有 N501Y突變的毒株仍然能被新冠病毒RBD特異性中和抗體中和。
復(fù)旦大學(xué)病原微生物研究所所長姜世勃告訴《知識分子》,“疫苗和抗體的開發(fā)商應(yīng)該盡快用突變的病毒來試一試,看他們疫苗研發(fā)的抗體或疫苗誘生的抗體是否照樣有效?如果不能有效中和值得注意,這是非常關(guān)鍵的。”
姜世勃還指出,應(yīng)盡快研究突變毒株的致病性是否增加,“如果致病性增加的話,將來它的致死率可能就增加了。”
各國紛紛采取隔離英國
最早發(fā)現(xiàn)新冠病毒這一新變體的英國,立刻投入到了新一輪的疫情防控。
從12月20日起,倫敦在內(nèi)的英格蘭東南部管控升級至4級封鎖。相比于此前的3級措施,新管控下非必要商店、理發(fā)店、健身房等娛樂場所全部關(guān)閉,除了教育、照顧孩子、鍛煉、購物或無法居家辦公的原因,在此區(qū)域的人要盡量居家,不同家庭不能聚集,只允許一對一的公共場合會面。
這些防控措施將持續(xù)到12月30日,英國政府屆時將再次做出評估。對英國來說,這意味著今年封鎖區(qū)的圣誕節(jié)將沒有聚會、圣誕集市和盛大的Boxing Day購物狂歡。而封鎖區(qū)之外的地區(qū)會在原管控措施下,在12月25日圣誕節(jié)這天放松管制。
在英國之外,多國已宣布禁止或暫停來自英國的人員入境。
12月20日,荷蘭首先宣布對英旅行禁令,將至少持續(xù)至2021年1月1日。此外,德國、愛爾蘭、比利時、奧地利、瑞士、葡萄牙、芬蘭、克羅地亞、保加利亞、意大利、瑞典、羅馬尼亞、愛沙尼亞、拉脫維亞、立陶宛、加拿大、印度、以色列、伊朗、沙特阿拉伯、土耳其、摩洛哥、薩爾瓦多、哥倫比亞和科威特等國也宣布了不同程度的對英旅行禁令。
與英國隔海相對的法國,則從12月20日23時(GMT)起暫停來自英國的客運(yùn)和貨運(yùn)48小時。此決定也將影響連接英國肯特郡與法國的海底隧道,該隧道通行歐洲之星火車和英國進(jìn)口食品及日常用品的貨車。
英國衛(wèi)生大臣馬修·漢考克認(rèn)為,英國國內(nèi)限制措施可能將持續(xù)數(shù)月,直到疫苗全面接種。
目前,英國已采購4000萬支輝瑞疫苗,在老人和醫(yī)療工作者中優(yōu)先接種。12月21日,英國交通部長格蘭特·沙普斯(Grant Shapps)在接受《天空新聞》采訪時表示,法國的貨運(yùn)禁令不會對英國的疫苗接種產(chǎn)生任何影響。
雖然這些報(bào)道的變異可能并不會影響到現(xiàn)有疫苗的效果,但如何與新冠病毒共處,如何應(yīng)對新冠病毒可能產(chǎn)生的其他變異,對于各國來說還是一個持續(xù)的考驗(yàn)。
“要么全球共同努力圍追堵截,加上疫苗,像消滅天花病毒和脊髓灰質(zhì)炎病毒一樣清除它,但是要以犧牲經(jīng)濟(jì)為代價。要么用溫和的隔離方式,像流感病毒一樣和它共存。”關(guān)于人類與新冠病毒的未來,石正麗向《知識分子》分析道。
“兩難在于,全球處理疫情的方式?jīng)]有達(dá)成共識。” 她補(bǔ)充說。
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